As atividades de pesquisa do Programa de Pós-Graduação em Ciências do Comportamento estão organizadas em torno de quatro grandes laboratórios:
- Laboratório de Análise Experimental do Comportamento
- Laboratório de Aprendizagem Humana
- Laboratório de Processos Cognitivos
- Laboratório de Psicobiologia
Além disso, docentes e alunos do programa também podem realizar suas atividades de pesquisa no LIPSI(Laboratório Integrado de Pós-Graduação e Pesquisa Experimental em Psicologia com Humanos), novo laboratório multifuncional do Instituto de Psicologia. Espaços no LIPSI podem ser utilizados mediante reserva.